В январе появился первый вирус для операционной системы Windows 95 — Boza. Так вирусы освоили новую революционную систему менее чем через полгода после её выхода.

В марте случилась первая эпидемия вируса для Windows 3.x — Tentacle. Отличительная черта этого вируса в том, что это был первый Windows-вирус, вырвавшийся на свободу. До той поры все Windows-вирусы жили только в коллекциях и электронных журналах вирусописателей, а в «живом виде» встречались только загрузочные, MS-DOS и макро-вирусы.

Июнь: OS2.AEP — первый вирус для OS/2, корректно заражающий EXE-файлы этой операционной системы. До этого в OS/2 встречались только вирусы, которые записывались вместо файла, уничтожая его или действуя методом «компаньон».

Июль: Laroux — первый вирус для Microsoft Excel, к тому же пойманный в «живом виде» практически одновременно в двух нефтедобывающих компаниях на Аляске и в ЮАР. Как и у Word-вирусов, принцип действия Laroux основывается на наличии в файлах так называемых макросов — программ на языке программирования Visual Basic. Такие программы могут быть включены в электронные таблицы Excel так же, как и в документы MS Word. Как оказалось, встроенный в Excel Visual Basic также позволяет создавать вирусы.

В середине октября в Microsoft произошел очередной инцидент, связанный с компьютерными вирусами: на веб-сайте компании, в одном из документов Word, посвященных технической поддержке программных продуктов Microsoft в Швейцарии, был обнаружен макро-вирус Wazzu. Позднее этот же вирус был найден на компакт-дисках, распространенных компанией на одной из компьютерных выставок. Однако на этом проблемы Microsoft с Wazzu не закончились: в сентябре вирус попал на компакт-диск Microsoft Solution Provider.

В целом 1996 год можно считать началом широкомасштабного наступления компьютерного андеграунда на операционные системы Windows 95 и Windows NT, а также на приложения Microsoft Office. За этот и следующий год появилось несколько десятков вирусов для Windows 95/NT и несколько сотен макро-вирусов. Во многих из них вирусописатели применяли совершенно новые приемы и методы заражения, добавляли стелс- и полиморфик-механизмы и т.п. Таким образом, компьютерные вирусы вышли на новый виток своего развития — уровень 32-битных операционных систем. За два года вирусы для 32-битных Windows повторили примерно те же стадии, что за 10 лет до того прошли MS-DOS-вирусы, однако на совершенно новом технологическом уровне.