Появляются новые вирусы — Datacrime, FuManchu (модификация вируса Jerusalem) и целые семейства — Vacsina и Yankee. Вирус Datacrime имел крайне опасное проявление — с 13 октября по 31 декабря он инициировал низкоуровневое форматирование нулевого цилиндра жесткого диска, что приводило к уничтожению таблицы размещения файлов и безвозвратной потере данных. Несмотря на небольшое распространение, Datacrime вызвал повальную истерию в мировых средствах массовой информации. Последовательно воспроизведенные многими печатными изданиями сведения об этом вирусе вызвали существенное искажение его реальной опасности и механизма действия. В США он даже получил название «День Колумба», причем некоторые издания предположили, что вирус был написан никем иным как норвежскими террористами, пытавшимися отомстить за то, что открывателем Америки считается Колумб, а не Рыжий Эрик.

16 октября 1989 на компьютерах VAX/VMS в сети SPAN была зафиксирована эпидемия вируса-червя WANK Worm. Для распространения червь использовал протокол DECNet и менял системные сообщения на следующий текст:

WORMS AGAINST NUCLEAR KILLERS
Your System Has Been Officially WANKed

WANK также менял системный пароль пользователя на набор случайных знаков и пересылал его на имя GEMPAK в сети SPAN.

Декабрь 1989: инцидент с троянской программой Aids. Некий злоумышленник разослал 20 тысяч дискет с пометкой «AIDS Introductory Information Diskette Version 2.0» по адресам в Европе, Африке и Австралии. Дискеты содержали троянскую программу, которая при запуске автоматически внедрялась в систему, создавала собственные скрытые файлы и директории и модифицировала системные файлы. Через 90 загрузок операционной системы программа шифровала имена всех файлов, делала их невидимыми и оставляла на диске только один читаемый файл — счет на 189 или 378 долларов США, который следовало оплатить и отослать по указанному троянской программой адресу в Панаме. Следствию удалось довольно быстро выявить автора троянца, которым оказался некий Джозеф Попп (Joseph Popp), позднее признанный невменяемым. Несмотря на это он был заочно приговорен к тюремному заключению итальянскими властями.

В сентябре 1989 увидела свет первая версия антивируса MсAfee VIRUSCAN. В том же 1989 году с антивирусным продуктом на рынок выходит образованная годом ранее тайваньская компания Trend Micro. В этом же году на международную арену выходят и другие антивирусы: F-Prot, ThunderBYTE, Norman Virus Control. Вирусная проблема начала привлекать внимание и компаний-гигантов. Так, в октябре появился в продаже антивирус от IBM, получивший название Virscan.